植物叶绿体基因组研究进展
摘要：叶绿体是植物细胞器的重要组成部分和光合作用的器官。它拥有自身完整的一套基因组，是植物细胞内具有自主遗传信息的重要细胞器。在生物进化的漫长历史中发挥了重要作用。由于其基因的特殊性，被广泛应用于揭示物种起源、进化演变及其不同物种之间的亲缘关系等方面。而叶绿体转化技术在遗传改良、生物制剂的生产等方面也有重要作用。所以对叶绿体的研究是必要的，从而收集整理了相关资料，主要从起源、结构、应用等方面对叶绿体基因组的研究进行综述。
关键词：叶绿体基因组； 起源； 结构；应用
一、文献综述
叶绿体是质体的一种，普遍存在与植物中，因其为绿色而得名。叶绿体基因组是伴随着染色体外遗传现象的发现而被认识的也是目前植物基因中较受重视的一类基因。
随着分子生物学不断的发展，对叶绿体基因组的研究日益深入。自从1962年Ris和Plaut用电子显微镜发现衣藻中的叶绿体DNA [1] ，近40年间对叶绿体的研究有了很大的突破。1986年首次获得烟草和地钱叶绿体基因组完整序列后[2]，叶绿体基因组数据库迅速增加充实，2006年底已经公布了包括生物界不同物种叶绿体基因组数据82组[3]。叶绿体基因组数据库迅速增加充实说明本领域的研究正在逐步被重视。
1 叶绿体基因组的起源
关于叶绿体的起源，从最早报道的叶绿体全基因组序列即1986年[1]，烟草和地钱的叶绿体全基因组序列测序完成至今，已有超过160种植物的叶绿体基因组序列被测定。许多科学家认为叶绿体起源于原始真核细胞内共生的蓝藻，1970年Margulis提出内共生起源假说：具备光合能力的蓝藻首先被没有光合能力的单细胞真核原生生物吞噬，由于没有被分解，从最初的寄生到成为了宿主细胞的细胞器最终形成相互依赖关系[4]。目前“内共生”理论被大家普遍认可但人们发现仅仅通过比较个别基因的遗传变异是不够的，基于个别序列分析的地理起源及系统发生方面仍存在许多疑问。
2 叶绿体基因组的结构特征
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