【摘要】20世纪后期,科学技术迅猛发展,以分子生物学和基因工程为先导的现代生命科学也取得了长足进步,大量新的理论和概念不断涌现并相应产生了许多新兴学科.生物信息学(bioinformatics)就是在人类基因组计划研究中 面对巨大且具有高度复杂性的生物数据管理和分析需要而产生和发展起来的一门新兴学科.它从事生物信息的获取、加工储存、分配、分析和释读,并综合运用数 学、计算机科学和生物学工具,以达到理解数据中的生物学含义的目标,揭示了'基因组信息结构的复杂性及遗传语言的根本规律',解释生命的遗传语言.生物信 息学、基因及蛋白质组学、现代数学、计算机及微电子技术等多学科的广泛渗透、融合发展,为中药学的临床及实验研究提供了有力的技术支持,同时也对中药现代 化研究提出了更高的要求.越来越多的中药界学者认识到,以系统和信息化的视角研究复杂的中药理论体系,从多层次信息中分析发掘和提取中药的科学内涵,探讨 中药的诊疗规律,揭示其本质对中药复方研究具有重要意义。
【关键词】生物信息学，中药复方，研究进展1.生物信息学及其特点生物信息学(bioinformatics)综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具来阐明和理解大量数据所包含的生物学意义 ，被誉为解读生命天书的慧眼 。
生物信息学的兴起及其快速发展在全球取得了巨大进展和成就，在组学、免疫学、药物研发、复杂疾病治疗等生命科学的各个科研领域的广泛应用，产生了巨大的和社会效益经济，并极大地推动了生命科学的研究和产业发展，是 21 世纪生命科学和自然科学重大前沿领域之一。
长期以来中药复方大多都沿用西药的研究思路,大多采用的是化学成分分离和简单的活性成分筛选相结合的方法, 虽然在一定程度上能够阐释中药复方的部分药效物质基础和作用机制, 但是由于中药复方具有多成分、多靶点协同整体作用的特点, 这种研究方法很难真正的阐释中药复方的科学内涵, 因此迫切需要我们发展一种适合中药复方作用特点的研究方法体系[1]。
随着系统生物学和生物信息学的发展, 各种组学技术如基因组学、蛋白质组学和代谢组学等在中药复方中迅速得以推广应用。
2.生物信息学在中药复方研究中的应用2.1确定复方作用成分中药复方一直长期沿用西药的研究思路，但是中药复方具有多成分、多靶点，突出多层次、多脏器、多水平的调节过程，其研究一直是中医药现代化研究的重点与难点之一。
网络药理学理念符合了中医辨证论治的理念与中药多成分、多靶点的特点，已被越来越多地应用到中药作用机制的研究中[2]。
文献[3] 运用分子对接技术将四物汤与银屑病有关联的活性成分筛选出来，再导入 Cytoscape 软件中构建分子 － 靶标、靶标 － 靶标和分子 － 分子的网络，推测四物汤主要是通过金属蛋白酶、表皮生长因子受体、一氧化氮合酶等来对抗银屑病表皮增殖、血管生成及异常的免疫调节机制[2]。
最典型的一个实例即是陈竺、陈赛娟院士领导的课题组采用系统生物学的研究手段, 在一定程度上揭示了复方黄黛片治疗急性早幼粒细胞性白血病的多靶点、协同作用机制 [1]。
2.2确定作用靶点一个药物可能作用于多个靶点，结构不用的药物也可能结合到同一靶蛋白上发挥作用。
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