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文献综述
1.引言随着人类基因组测序的完成，以功能基因组学和蛋白质组学为主要研究内容 的后基因组时代已经到来。
蛋白质是生物体的重要组成成分，在各种生命活动过 程中起着不可替代的作用。
蛋白质的功能是当前生命科学领域的研究热点问题。
蛋白质与配体的相互作用和识别是蛋白质发挥其生物功能的重要途径，在各种生 命活动中扮演着非常重要的角色，比如基因调控、信号传导、免疫应答等都离不 开蛋白质与配体的相互作用。
因此，研究蛋白质与配体的相互作用机制对于理解 生物体调控机制至关重要。
此外，蛋白质与配体作用机制的研究也为基于结构的 新药研发提供必要的理论基础。
由于采用实验方法测定蛋白质复合物结构尚存在较大的困难，近年来，随着 计算机处理能力的不断增强以及理论模拟方法的迅速发展和广泛应用，分子动力 学模拟、分子对接和自由能计算等分子模拟方法已经成为研究蛋白质受体与其配 体相互作用机制及其动态过程的重要手段。
分子模拟方法为从分子、亚基甚至原 子层次上了解生命现象及揭示其本质规律提供了很好的手段，并可为实验结果提 供有力的理论支持。
随着分子模拟的理论完善及技术的进步，分子模拟方法正越 来越多地被用于蛋白质结构-功能关系、蛋白质与配体的相互识别以及药物设计 的研究工作当中。
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