鹅掌楸LcKNOX基因克隆及生物信息学预测文献综述

 2022-08-03 02:08

文献综述:鹅掌楸Lc基因研究

1 鹅掌楸研究进展

鹅掌楸属(Liriodendron)是木兰科(Magnoliaceae)第三季孑遗植物树种,被认为是被子植物中最原始的类群之一。自然条件下,目前现存两个种,即鹅掌楸和北美鹅掌楸。鹅掌楸原产中国,因叶形奇特,形似“马褂”,由此得名“马褂木”,主要生长在长江流域以南,其分布区东起浙江省青田县(约120°17rsquo;E),向西直至云南省金平县(约103°15rsquo;E),北界为陕西省紫阳县(32°38rsquo;N),向南至云南省金平县(22°37rsquo;N),再向南一直可延伸到越南北部,大多在海拔600~1500m之间的低山地零星生长。据调查我国的11个省84个县有鹅掌楸自然分布,包括江苏、安徽、浙江、福建、湖北、湖南、广西、陕西、四川、贵州、云南等,但一般东部、中南部较分散,而西部相对较集中。然而,现存资源十分稀少,已被我国列为二级珍稀濒危保护树种[1]

2 KNOX基因的研究进展

2.1 KNOX基因的发现

由同源异型盒基因家族(homeobox gene family)编码的蛋白作为转录因子,在细胞体形态建成中起重要作用。最早的同源异型盒基因发现与果蝇,第一个从植物中分离出来的同源异型盒基因是从玉米(Zea mays)中得到的KNOTTED1(KN1或ZmKN1)。此后人们相继从拟南芥、水稻、大麦等植物中克隆到与KNOTTED1相似的基因,这些基因形成一个家族,即KNOX家族。lrm;[2]

2.2 KNOX基因的分类

研究者根据基因核苷酸序列的相似性、所编码蛋白质同源结构域中氨基酸序列的相似性,以及表达模式的不同,将分为两类亚家族:KNOX I亚家族和KNOXⅡ亚家族,其中KNOXⅡ在所有植物组织中都有表达,目前对其研究较少。KNOXⅠ则在分生组织中表达,调控与器官发生相关的细胞分化,影响细胞形态构成。拟南芥中classI类基因成员包括STMKNAT1(Knotted in Arabidopsis thaliana / BREVIPE-DICELLUS; BP)、KNAT2KNAT6,两类亚家族成员之间具有比较大的结构差异性,亚家族内的蛋白质结构则具有高度的保守性[27]。除结构外,它们的表达模式也有较大差异。 I主要在分生组织中特异表达,进而影响侧生器官的发育,其单基因突变表现出较为强烈的发育及形态上的变化。ClassI类基因在分身组织中表达,在植物体内,KNOX蛋白通过调控其靶标基因进而调控激素在分生组织中的体内平衡,同时它和另一个同源异形域BELL亚家族蛋白形成异源二聚体,最终达到调控赤霉素和木质素的生物合成途径,从而决定细胞命运[3]

2.3 KNOX基因与激素间的调控

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