江苏地区圈养丹顶鹤MHC基因的遗传多样性研究文献综述

 2022-04-11 09:04

丹顶鹤MHC基因遗传多样性研究方法论述

1. 遗传多样性的研究与发展

遗传多样性是指地球上所有生物所携带的遗传信息的总和。但一般所指的遗传多样性是指种内的遗传多样性,即种内个体之间或一个群体内不同个体的遗传变异总和。种内的多样性是物种以上各水平多样性的最重要来源。遗传变异、生活史特点、种群动态及其遗传结构等决定或影响着一个物种与其它物种及与环境相互作用的方式。而且,种内的多样性是一个物种对人为干扰进行成功反应的决定因素。种内的遗传变异程度也决定其进化的趋势。遗传多样性可以表现在多个层次上,如分子、细胞、个体等。在自然界中,对于绝大多数有性生殖的物种而言,种群内的个体之间往往没有完全一致的基因型,而种群就是由这些具有不同遗传结构的多个个体组成的。检测遗传多样性的方法随生物学尤其是遗传学和分子生物学的发展而不断提高和完善。从形态学水平、细胞学(染色体)水平、生理生化水平、逐渐发展到分子水平。然而不管研究是在什么层次上进行,其宗旨都在于揭示遗传物质的变异。

2. 分子标记技术的发展

近十年来多种分子标记的出现和发展则促进了保护遗传学研究的发展。从同工酶到高通量单核苷酸多态性(SNP)标记,分子标记技术的不断发展使野生动物保护遗传学研究内容得到了极大丰富较早的基于基因表达型的分子标记,如同工酶,存在标记数目有限、多态性位点较少、易受环境影响等缺点。通过聚合酶链式反应(PCR),研究者则可利用微量的DNA样本实现对特定基因的大量扩增,基于此技术产生了多种应用广泛的遗传标记类型如随机扩增多态性DNArandom (amplified polymorphic DNA,RAPD)、扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)、单链构象多态性(single-strand conformation polymorphism,SSCP)、微卫星(microsatellite DNA)等。利用这些遗传标记结合非损伤遗传取样法,能够实现个体鉴定、性别鉴定、亲缘关系识别、遗传多样性评估、种群遗传结构识别、种群遗传变异分布格局与机制分析等种群遗传学和保护遗传学研究目的。

3. 主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex, MHC)的研究

3.1主要组织相容性复合体

主要组织相容性复合体是脊椎动物基因组中紧密连锁的基因家族,其遗传变异水平与脊椎动物的疾病抵抗能力密切相关,直接影响着个体乃至整个种群的适合度(Sommer 2005, Minias et al. 2016)。MHC基因的遗传变异水平已成为评估濒危野生动物适应进化潜力的重要指标(Sommer 2005,蓝泓2014, Akiyama et al. 2017)。根据MHC分子呈递的抗原类型,可将其分为MHC-I和MHC-II两个亚家族。MHC-I经典分子参与内源性抗原的呈递,MHC-II经典分子则与外源性抗原的呈递相关(Minias et al. 2016)。两类MHC分子结构基本相似,都是以非共价键形式结合而成的异源二聚体,其间的抗原结合区是MHC分子多态性最为丰富的区(蓝泓2014)。

3.2 MHC基因的分类结构及功能

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