嗜热栖热菌 D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶 的理性设计文献综述

 2022-01-04 08:01

全文总字数:5928字

文献综述

1.D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶的简介D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶可以催化两分子D-丙氨酸缩合为一分子D-丙氨酰-D-丙氨酸二肽。

该二肽在D-丙氨酸添加酶MurF的催化下连接到胞壁酸上[1],胞壁酸是合成肽聚糖的前体,肽聚糖是细胞壁的主要成分,因此D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶对细胞物理结构的稳定至关重要[2]。

酶的ATP结合超家族共同拥有一个称为ATP结合折叠的非典型核苷酸结合位点。

这些酶在日常生活的许多生化反应中都有着广泛应用。

其中ATP结合酶D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶(Ddl)是最早表现出特征的ATP结合酶之一,它催化两个D-丙氨酸分子的能量依赖性结合形成D-丙氨酰-D丙氨酸二肽,因此对于细胞壁生物合成至关重要。

由于这一重要作用,Ddl已被作为抗生素药物靶标加以研究,并已被确定为二线抗结核药D-cy closerine(DCS)的主要靶标[3]。

D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶(Ddl)被单价阳离子K 激活,尽管有临床相关性和数十年的研究,但尚未阐明这种激活的发生方式。

研究证明,活化的单价阳离子与嗜热栖热菌的Ddl的活性位点结合,并使用生化和结构化相结合的方法来促使单价阳离子激活。

研究发现嗜热栖热菌Ddl是II型单价阳离子激活的酶,在没有单价阳离子的情况下仍保持活性。

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