利用二代测序技术获取杨树F1代SSR标记数据并构建遗传图谱文献综述

 2022-04-10 10:04

利用二代测序技术获取杨树F1代SSR标记数据并构建遗传图谱

杨树背景介绍

1.1杨树的生物学特性

杨树,属于杨柳科(Salicaceae)杨属(Populus)树种,是中国重要的速生用材、生态防护与园林绿化树种。杨树是落叶乔木;树干通常端直;树皮光滑或纵裂,常为灰白色。有顶芽(胡杨无),芽鳞多数,常有粘脂。枝有长(包括萌枝)短枝之分,圆柱状或具棱线。叶互生,多为卵圆形、卵圆状披针形或三角状卵形,在不同的枝(如长枝、短枝、萌枝)上常为不同的形状,齿状缘;叶柄长,侧扁或圆柱形,先端有或无腺点。种子小,多数,子叶椭圆形。

1.2杨树的地理分布

杨树是世界上分布最广、适应性最强的树种。主要分布北半球温带、寒温带森林树种,北纬22°到70°,从低海拔到4800米。在中国分布范围跨北纬25°~53°,东经76°~134°,遍及东北、西北、华北和西南等地。全世界约100余种,通常根据其地域分布、形态特点可分为五派:(1)黑杨派(Sect. Aigeiros Duby);(2)白杨派(Sect. Populus);(3)青杨组 (Sect. Tacamahaca);(4)大叶杨组(Sect. Leucoides);(5)胡杨组(Sect. Turanga)。

1.3杨树的用途

我国在杨树科学研究上取得很多成就,成功地引进和自己选育出一批杨树优良无性系品种,经大面积推广,已形成巨大生产力,经济效益显著。进行了丰产栽培技术组合成丰产栽培模式和配套技术,缩短了轮伐期,提高了产量了木材质量。在杨树病虫害防治方面,提出了一些确实有效的方法和综合防治技术。正是因为采用了优良的杨树品种与中产栽培举措,十几年来我国的新造杨树人工林,单位面积的产量较以前都有所提高,轮伐期也在不断缩短。

杨树可广泛用于生态防护林、三北防护林、农林防护林和工业用材林。杨树作为道路绿化,园林景观用也是一个非常优秀的树种。其特点是高大雄伟、整齐标志、迅速成林、能防风沙和吸收废气。

杨树不仅具有经济和生态价值,同时作为林业研究中的模式植物,其具有以下特性:(1)基因组相对较小,约450到550Mbp,易于进行遗传学研究。其基因组学,分子生物学等各方面的研究已经具有了良好的基础;(2)分布广泛,其自然分布于热带非洲以及从北纬 19 度至70 度的北半球;(3)生长快,遗传转化容易,再生能力强,易于无性繁殖,种间杂交。

SSR标记

    1. SSR标记的概念

简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR)指的是基因组中由1-6个核苷酸组成的基本单位重复多次构成的一段DNA,广泛分布于基因组的不同位置,长度一般在200bp以下[1]。SSR标记是一种通过直接分析遗传物质的多态性来鉴别生物内在的核苷酸排布及其外在状态表现规律的技术[2]

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