三磷酸甘油酯脱氢酶底物单氟和二氟膦酸二甲酯类似物的合成及其x射线结构文献综述

 2022-01-04 09:01

全文总字数:5867字

三磷酸甘油酯脱氢酶底物单氟和二氟膦酸二甲酯类似物的合成及其x射线结构

摘要:报道了(IRS,3S)-3,4-二羟基-1-氟丁基膦酸3和(S)-二氟-3,4-二羟基丁基膦酸4的环己基铵盐的合成。这些化合物是3-甘油的磷酸膦酸酯类似物,其中桥连的磷酸酯氧分别被CHF和CF2取代。 提出了用NADH连接的3-磷酸三酰甘油脱氢酶进行氧化的动力学研究,该研究表明CHF-膦酸酯3与天然底物sn-甘油-3-磷酸酯具有相似的性能,并且是比CF2-膦酸酯4更好的底物。该研究还揭示了3(3a和3b)的非对映异构体的加工速率不同,表明该酶可用于区分CHF立体异构中心。描述了2-氨基-1-氟乙基膦酸7的合成和X射线晶体结构,从而比较CHF膦酸酯与类似CH2和CF2膦酸酯的几何构型。

导言

在生物有机化学中,膦酸酯作为可稳定水解的磷酸酯模拟物的潜力被公认多年。膦酸酯的CH2部分取代了磷酸基团的桥连氧,使其具有抵抗磷酸酶的水解的能力。取代CH2的氧可以与底物保持相同的功能空间分布,并允许接近相似的构像,这对于蛋白质结合而言显然是重要的特征。

但是,氧的高电负性使得其无法与CH2匹配。因此,这种取代所引起的电子后果可能是具有危害性的。例如,膦酸酯的第二次去质子化的pKa约为7.6,二磷酸基团的pKa约为6.4。由于氟原子的电子拉宽效应,将氟原子引入亚甲基增加了膦酸酯的酸度。近年来,这种改变被证明很受欢迎,并且在药学文献中出现了许多报道,其中在单-,二-和三-磷酸酯体系中对这种取代进行了深入研究。鉴于此,令人惊讶的是,尽管有一些明显的优点,但单氟亚甲基膦酸酯(CHF-膦酸酯)却很少受到关注。CHF膦酸酯第二次去质子化的pKa为6.5,与设计模拟的磷酸基团的pKa基本相同。在最近的理论分析中,预计CHF膦酸酯与磷酸酯基团的静电分布极为接近。

我们对氟化膦酸酯的合成十分感兴趣,因为它是糖酵解途径中单磷酸酯的模拟物。以前我们通过外消旋的形式制备了CF2-膦酸酯4(一种sn-甘油-3-磷酸1的类似物),并证明它是NADH连接的3-磷酸甘油脱氢酶的底物。但是,经过初步研究表明,这种CF2-膦酸酯类似物是一种比sn-甘油3-磷酸酯更差的底物!有趣的是,两项研究表明,CH2-膦酸酯类似物与天然底物1本身一样是脱氢酶的优良底物。显然,氟原子的加入影响到了CF2-膦酸酯的性能。因此,评估相应的CHF-膦酸盐类似物3作为脱氢酶的底物来评估中间状态是一种合适的方法,因为膦酸盐alpha;-碳上有一个氟原子。为了直接比较CF2-膦酸酯4和天然底物1,我们认为有必要评估纯手性CF2-膦酸酯而不是先前制备的4消旋体的底物性能,以便消除非天然对映体是一种酶抑制剂,从而导致外消旋物的性能较差的可能性。

还值得注意的是,目前尚无有关CHF膦酸酯部分的结构数据,因此我们认为有必要解决这一不足。比较CHF-膦酸酯与磷酸盐以及CH2-和CF2-膦酸酯类似物的几何构型是很有意义的。由于已知2-氨基乙醇磷酸5,2-氨基乙基膦酸6和2-氨基-1,1-二氟乙基膦酸8的晶体学数据,我们决定制备相应的单氟化膦酸酯7,以便与这些结构进行直接比较。因此,在本文中,我们描述了CHF-膦酸酯3和CF2-膦酸酯4的合成的完整细节,并对它们作为3-磷酸甘油脱氢酶的底物进行了评价。同时本文还介绍了了氨基CHF膦酸酯7的合成和其X射线晶体结构。

结果与讨论

膦酸酯类似物的合成。已经报道了几种合成单-氟代膦酸酯的方法。用亲电氟化试剂直接将膦酸酯阴离子氟化是一种全新方法,同时还探讨了用诸如DAST之类的试剂处理alpha;-羟基膦酸酯。或者,通过使用Michaelis-Becker反应或 Michaelis-Arbuzov反应,以氯氟甲烷为起始原料,允许其进入各种CHF膦酸酯体系,尽管氯氟甲烷是有毒的且不易制备。为了获得(1RS,3S)-3,4-二羟基-1-氟丁基膦酸酯3,我们采用了最近报道的一种方法,通过使用alpha;-锂-alpha;-氟代三氟甲硅烷基甲基膦酸酯碳负离子10引入CHF膦酸酯。在氯代三甲基硅烷存在下,通过与正丁基锂进行双卤素交换,可以很容易地从二溴氟甲基膦酸酯9获得(方案1)。通过10与(R)-2,2-二甲基-4-甲基-1,3-二氧戊三氟酸酯11的烷基化反应,有效地合成了alpha;-氟(三甲基硅基)丁基膦酸酯12。虽然可以分离出12,但证明一锅法合成更为方便,在反应混合物中直接加入乙氧化锂,用水溶液处理并回收13。用溴三甲基硅烷处理13,然后加水得到所需的单氟膦酸,为差向异构体的1:1化合物。该化合物经中和后分离出双环己基铵盐3

  1. i,n-BuLi(2.2 equiv),Me3SiCl,THF,-78℃,10min;ⅱ,11,-78℃;ⅲ,LiOEt/EtOH,0℃,1h then eq.NH4Cl-ether,83%;ⅳ,Me3SiBr,room temp,3 h then H2O,room temp,18h;v,C6H11NH2,63%.

我们制备CF2-膦酸酯类似物4的方法是通过在氟化物催化下将二氟(三甲基甲硅烷基)-甲基膦酸酯15加到羰基化合物中来形成1,1-二氟-2-羟基烷基膦酸酯的先前方法即方案2)。 通过使用正丁基锂和三甲基氯硅烷使溴二氟甲基膦酸酯14直接甲硅烷基化,可以轻松制备甲硅烷基化的膦酸酯15。因此,15与(S)-2,3-O-异亚丙基甘油醛16在四丁基氟化铵存在下水解后,在新生成的甲醇立体中心下,以同分异构体的混合物的形式生成了1,1-二氟-2-羟丁基膦酸酯17。为了进行Barton脱氧,在回流的四氢呋喃中用硫代羰基双咪唑处理17,得到硫代咪唑化物18

  1. i,n-BuLi,Me3SiCl,THF,-78℃,20min,92%;ⅱ,16,TBAF,THF,room temp,24h then sat.aq.NaHCO3,2h,36%;ⅲ,Im2C=S,THF,reflux,3h,81%;ⅳ,Bu3SnH,AIBN,toluene,reflux,2h,66%;v,Me3SiBr,room temp,3h,then,H2O,15H;ⅵ,C6H11NH2,30%.

在回流甲苯中用三丁基锡氢化物在AIBN存在下还原18生成所需的CF2-膦酸酯19,该CF2-膦酸酯19以通常的方式去保护并分离为其双环己基铵盐4

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