基于STING激动剂的虚拟筛选文献综述

 2023-02-17 08:02

一、 课题研究的背景与意义

近年来肿瘤免疫疗法已经成为制药工业的最大开发热点,除了免疫哨卡抑制剂、细胞免疫疗法取得举世瞩目的成功之外,小分子免疫疗法也引起制药业的关注[1]。最近Aduro生物技术公司的环二核苷酸(cyclic dinucleotide,CDN)类干扰素基因刺激蛋白(STimulator of INterferon Genes,STING)激动剂(比如ADU-S100)在多个小鼠接种模型中的疗效引人注目。干扰素基因刺激蛋白(STING)是一种跨膜蛋白,通常在152-173位区域(dimerization domain,DD)交接形成二聚体并处于自我抑制状态。当受到部分配体(比如CDN)的刺激后分子构型发生变化并被激活,招募细胞质中的TANK结合激酶1(TANK-binding kinase 1,TBK1),介导TBK1对IRF3的磷酸化,导致干扰素(interferon,IFN)-beta;和其它多种细胞素(cytokines)的形成[2-3]。将sting激动剂直接注射到多种难治性,转移性固体肿瘤,不仅直接注射的肿瘤消失,其它部位的肿瘤生长也受到明显抑制,甚至还可以预防肿瘤的发生[4]

环二核苷酸(cyclic dinucleotide,CDN)是到目前为止发现的唯一一类既能直接激活鼠源又能激活人源STING蛋白的STING激动剂[5]。为了更精确更快速的找到能激活人源的STING激动剂,本课题欲采用小分子虚拟筛选技术,将STING蛋白作为受体大分子,建立小分子数据库,从中筛选出与受体大分子结合结构好、强度好的目标小分子。与高通量实验筛选的阳性率(0.01%~0.1%)相比,虚拟筛选的阳性率(5%~30%)远高于其,并且大大降低了实验筛选化合物数量,缩短研究周期,节约研究经费[6-8]

二、课题研究的内容

通过查阅文献,了解研究课题的背景和意义,主要研究基于sting激动剂的小分子虚拟筛选。选择合适的分子对接方法(如dock),通过测定受体生物大分子(sting蛋白)的三维结构[晶体结构、核磁共振 (NMR)结构、低温电镜结构或计算机模拟结构] [9],从现有小分子数据库中,搜寻与靶标生物大分子结合或符合QSAR模型的化合物,进行实验筛选研究 [9-11]

三、 研究手段

为了保证本论文能顺利完成,本课题拟采用2种研究手段与研究方法:

1)文献法

对文献进行查询、鉴别、整理、分析、对比、总结和归纳,学习sting激动剂及虚拟筛选技术相关知识,并寻求本课题具体采用的研究方法及解决方案。

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