结直肠癌多维度数据整合分析文献综述

 2023-02-15 06:02

一、课题解决的问题

结直肠癌是常见的消化道肿瘤之一,占我国恶性肿瘤的第四位,并有上升的趋势。结直肠癌发病的地域分布差异大,其中发达地区高于欠发达地区,城市高于农村。我国是结直肠癌的低发区,但发病率呈逐年上升趋势。自从二十世纪 80 年代以来,由于早期的发现与治疗,一些发达国家的结直肠癌死亡率正在不断下降。但在医疗条件不好的地区,如中美、南美和中国的农村地区,结直肠癌的死亡率仍在不断上升中。结直肠癌在早期缺少症状,病人无明显异常改变,所以多数患者初次就诊时结直肠癌病变就已进入中晚期,很难得到有效根除,严重威胁人民的健康。众所周知,拥有相同癌症的病人对相同的治疗方案可能有不同的治疗结果,这是因为分子水平的变化导致的个体差异性。因此,基于大量临床样本的数据,利用生物信息学的方法,深入了解结直肠癌疾病在人体内部的发生、发展、转移分子机制是很有必要的,这将会给临床医生根据疾病不同的发展阶段制定精确的治疗方案提供重要的依据,达到个性化治疗的阶段。

二、研究方法和技术路线

本课题基于TCGA数据库,主要采用统计学方法,运用R语言。基本路线是:先从TCGA网站上下载结直肠癌的基因组数据(比如拷贝数变异和DNA甲基化),然后得到它们的匹配样本;然后通过QQ图判定使用非参数方法spearman方法或者pearson方法单独分析基因组数据之间是否存在相关性,比如拷贝数变异和甲基化之间是否有关联;最后根据相关系数排序得到相应的基因。

三、论文课题研究进度安排

2017年3月10日----3月14日 确定选题,查阅文献。

2017年3月15日----3月24日 撰写开题报告,查阅文献。

2017年3月25日----5月1日 分析数据、收集资料。

2017年5月2日----5月27日 提交论文初稿。

2017年6月8日前 修改论文,完善系统

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