动物数字病理平台的构建及应用文献综述

 2023-02-10 12:02

动物数字病理平台的构建及应用课题性质 基础研究 应用课题 设计型 调研综述 理论研究一、课题研究背景病理切片数字化是病理诊断技术划时代的变革,它的实现可使病理医生脱离显微镜,随时随地通过网络解决病理诊断,实现全球在线同步远程会诊或离线远程会诊,由于提供全切片信息,使诊断价值等同显微镜观察,其时间空间穿插传递优势具有重大意义。

而数字病理平台则是对数字切片进行浏览、管理、存储的重要工具,但由于数字切片占用超大空间、超大分辨率、大比例缩放困难等特点,国内目前尚有的病理切片平台的开发和应用远远不能满足各地实验室、医院的需求。

二、课题研究意义本课题针对动物数字病理切片的存储、浏览、在线标注等过程,运用asp.net网站开发技术,构建一个可供医务人员随时随地轻松使用的应用平台,同时集成大数据分析和人工智能深度学习技术,通过构建自动标注和智能分析模型,为病理医生大大减轻阅片量和提高诊断的准确率 。

三、拟解决的问题针对已有标注数据采集系统的不足,本研究使用web技术设计和实现一个基于浏览器/服务器的结构的平台,用于大尺寸、高分辨率数字病理图像的管理和标注数据采集。

四、研究主要内容病理切片的加载与缩放;上传大图像至云数据库;图片在线标注工具;搭建深度学习模型自动标注切片癌变部位。

五、研究方法和步骤.net框架极大的简化常用HTML、CSS文件操作,通过javascript控制网页的行为和响应;使用webuploader文件上传组件,将大文件分割成多块并发上传,极大提高文件上传速率;采用deepzoom技术对原始图像数据进行处理和分级存储,生成DZI格式图片;在网页中使用开源免费的OpenSeadragon图像控件实现对DZI格式的支持,完成图像基础显示功能;通过新建图层,使用数据驱动文档(D3,Data-Driven Documents)控件实现缩放矢量图形(SVG)的显示,以显示图像标注数据的轮廓信息;使用MySql数据库管理系统对相关数据进行存取;总结研究意义以及还能进一步改进的地方。

六、文献综述1.病理切片平台对于图像标注的意义图像采集、存储技术的发展成熟降低了图像采集应用的成本,也促进了图像处理与识别技术在各领域的应用发展。

图像分析与识别技术的应用依赖于特定图像识别算法的构建,而图像识别算法的实现和优化过程需要大量带有标注信息的图像作为数据集。

数据集的质量和数量可直接影响算法的实现效果。

数字病理图像标注数据采集过程效率低的原因是图片尺寸大、分辨率高、具有专业知识的标注人员少。

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